劉永福和羅鳴芳從台北府庫中取出銀子和武器，分頭前往彰化和基隆。如今的章軍不缺槍也不缺銀子，台灣日軍投降後，在台北基隆留下了大量的武器彈藥和錢糧，這些物資原本是用於強化對台灣的殖民統治，現在卻成了周憲章重建台灣的啟動資金。
唐才常帶著自立軍回到了上海，繼續秘密開展維新保皇運動。此時，國內的維新運動如火如荼，康有為在上海，梁啟超在湖南，大肆活動，宣傳維新改良。上海道台黃遵憲，湖南巡撫陳寶箴都是維新黨人的得力幹將，他們利用手中的權力，在管轄區域內推動維新運動。在朝廷上，原先以翁同龢為首的清流派也完全倒向了維新黨，成了維新黨人的傳話筒。
大清國朝野上下，掀起了維新改良的浪潮。一時間，維新改良似乎成了天下大勢，北京的王公大臣們，言必維新，似乎不談維新，就趕不上時髦。滿清朝廷也不得不做出維新改良的姿態，邀請唐有為入朝以備谘詢。
就連外國人也以為，維新黨人風頭正勁，維新變法勢在必行。
唐才常得到了周憲章給的銀子和武器，在上海擴大自立軍，很快就拉起了一支兩千多人的隊伍。
唐才常是康有為的忠實信徒，他和梁啟超不同，是激進的維新黨人。康有為和唐才常認為，維新變法必須是以皇帝為主導，自上而下，以摧枯拉朽之勢，在全國展開。這就要求，光緒皇帝徹底擺脫以慈禧太後為首的滿清保守黨的製約，實現乾坤獨斷。而慈禧太後是不可能和平交權的。所以，康有為與唐才常決定，效仿日本明治維新的做法，在必要的時候，率自立軍進京勤王，發動政變，以鐵血政策徹底鏟除包括慈禧在內的保守勢力，以維新黨人輔佐光緒皇帝，開展維新變法。
唐才常忠實地執行康有為的主張，但畢竟實力有限，經過好幾年的籌備，也隻拉起了一支一百多人的隊伍，力量太過弱小，勤王保皇遙不可及。如今，得到了周憲章的資助後，自立軍迅速壯大起來，現在。有了一支屬於自己的武裝力量，康有為終於有了一展抱負的底氣。
所以，康有為對周憲章大為感激，也對周憲章充滿了希望。他甚至認為，周憲章送給唐才常武器和銀子，就表明，他已經站到了維新派一邊。康有為甚至計劃好了，一旦時機成熟，唐才常率自立軍在北京發動軍事政變，周憲章率章軍隊朝廷形成壓迫之勢，裏應外合，一戰成功！
相對於維新黨人的風光，革命黨人的就顯得極為艱難。事實上，在十九世紀末期，維新與革命是兩個此消彼長的力量，當維新變法思想蓬勃興起，革命思想就顯得更加孤立。革命是要流血的，而維新則是一種溫和的改良，既然總是要變革，民眾自然會選擇不流血的維新。
所以，國內維新運動聲勢高漲，而在國外的革命黨人，則是陷入了低潮之中。秋瑾回到日本後，很多留日學生投入到了維新黨的懷抱中，就連海外華僑，也開始懷疑孫文的革命主張，畢竟，推翻帝製，在廢墟上重建一個全新的中國，付出的代價太大了！
因為得不到民眾的支持，革命黨人舉步維艱，在國內的活動幾乎全部停止，在海外，他們的呼聲也被如火如荼的維新運動淹沒了！
不過，孫文和秋瑾對周憲章還是充滿了希望。孫文知道，周憲章的骨子裏，早已對大清國朝廷徹底失去了信心，章軍的興衰沉浮，已經說明，那個朝廷即便是維新變法成功，仍然容不下周憲章。
且說，周憲章送走了秋瑾和唐才常，心裏鬆了一口氣。台灣剛剛經曆了一場戰爭，百廢待興，再也經不起折騰，這兩派人離開了台灣，台灣民眾和章軍官兵的思想不至於發生混亂，大家可以安下心來，好好把經濟建設搞好，等大家的日子過好了，再考慮政治問題。
周憲章剛剛回到總督府，羅鳴芳和漢納根就匆匆跟了來。
日本人的談判代表已經到了基隆港，要求和台灣最高軍政長官商談有關衝繩事宜。郭二杆和李國革占著琉球，兵鋒直指日本的九州島，日本人寢食難安。
在這之前，周憲章和劉永福演了一出雙簧。周憲章以大清國總理衙門大臣的名義，上表朝廷，委任劉永福為台灣巡撫，同時，任命丘蓬甲、吳彭年等二十多個台灣本地士紳，為台灣各地知府、知縣等行政長官。
而劉永福則是給朝廷上了一道萬人簽名的請願書，代表台灣民眾，請求朝廷任命周憲章為台灣總督。
大清國對此還沒有正式答複。不過，周憲章已經走馬上任，當上了台灣總督，也就是台灣的最高軍政長官。事實上，不管是章軍官兵還是台灣民眾，都沒把朝廷放在眼裏，不管朝廷如何答複，周憲章這個總督是當定了。周憲章和劉永福的表章，其實隻是要向民眾傳達一個信息——台灣不是一個獨立王國，它是中國的一部分！
周憲章問道：“他們的談判代表是誰？”
“是外相陸奧宗光。”羅鳴芳說道。
“是嗎？”周憲章一聲冷笑：“這就是說，日本人把台灣，看成了與日本平起平坐的獨立國家！”
“可以這麽說。”漢納根說道：“從法理上講，章軍仍然是大清國的軍隊，章軍對琉球的占領，應該是大清國對琉球的占領。按照這個邏輯，他們的外務省，應該與大清國朝廷談判，而現在，他們的代表撇開朝廷，直接來了台灣，這是把台灣當成了一個獨立國家。”
周憲章沉吟片刻，說道：“漢納根先生，如果台灣獨立建國，西方會怎麽看？”
漢納根想了想，說道：“這個世界原本就是個弱肉強食的世界，如果周將軍擁有足夠的實力，我想，西方會承認的。畢竟，西方各國謀求的，是經濟利益，他們不會像日本人，對台灣有領土要求。”
羅鳴芳說道：“大哥，既然如此，咱們幹脆就……”
“就什麽！”周憲章打斷了羅鳴芳的話：“如果我成了鄭成功第二，那就是千古罪人了！”周憲章是從二十一世紀穿越而來的，他知道，台灣如果真的與大陸割裂開來，那將遺禍無窮，台灣從大陸分裂出去將是一個民族的災難！周憲章即便現在能夠得到民眾的支持，百年之後，仍然要背上千古罵名！
日本人這是在耍花招，他們這是挑撥離間，鼓動周憲章脫離中國。一旦台灣與中國大陸分開，日本人就有機會拿回他們想要的東西！
大清國朝廷懦弱無能，可是，在目前，它仍然是中國的合法中央政府。周憲章不想擔一個分裂國家的千古罵名，要維護國家統一，就必須要維護大清國朝廷的臉麵。
周憲章說道：“你去告訴陸奧宗光，他找錯了談判對象，他應該去大清國的總理衙門遞交國書。”
“大哥，琉球是我們打下來的，讓朝廷撿了落地桃子，這也太不公平了。”羅鳴芳不服。
“當然不能讓朝廷撿桃子！”周憲章笑道：“琉球在我章軍手裏，朝廷也撿不了這個桃子。咱們隻是給朝廷一個麵子，讓朝廷接受日本人的談判國書，至於誰去和日本人談，朝廷應該明白，除了我章軍，誰敢去和日本人談條件！他們談了也不算數啊！”
羅鳴放這才明白過來：“大哥說的沒錯，朝廷隻能委派大哥你去做全權談判代表。”
周憲章點點頭：“這也是給日本人一點顏色看看，媽的，想談就談，哪有那麽容易的事！讓他們先去北京兜個大圈子再說。”
琉球在章軍手裏，周憲章不急，急的是日本人。甲午戰爭時，大清國派出張萌桓和邵有廉到廣島去和日本人談判，遭到日本人極為傲慢的拒絕。現在，周憲章也要讓日本人嚐嚐這個滋味。
漢納根歎道：“朝廷那麽對待你，你還要維護朝廷的麵子。”
“我維護的不是滿清朝廷的麵子，而是國家的統一！”周憲章說道：“羅鳴芳，你再去告訴日方陸奧宗光，他的規格不夠！要想談判，得換人。”
“他是外相了，官不小了。”羅鳴芳說道。
“涉及琉球的主權問題，一個外相做不了主。”周憲章說道：“讓他們的首相伊藤博文來！否則，一切免談！”
“是！”羅鳴芳轉身要走。
“慢著，你告訴陸奧宗光，現在是年底了，我周憲章忙的很，沒時間，要談判，來年吧。”
“大哥，你都忙啥呢？”羅鳴芳問道。
“台灣讓日本人打成了爛攤子，還不夠我忙一陣子嗎？”周憲章說道：“況且，我馬上要去朝鮮，羅鳴芳，朝鮮也是我章軍的領地！我得去瞧瞧，樸永烈和馮國璋這兩個家夥幹得怎麽樣。”