攻取古裏河及定遠城的戰鬥，火銃大隊發揮了決定作用，有鑒於俄軍普遍使用火槍的情況，第一步兵聯隊的兩個長矛大隊被剝離出來，統歸入第二步兵聯隊，從達斡爾及索倫和一些漢民中挑選了六百人組建新的火銃大隊補入第一步兵聯隊，因此整編後的第一步兵聯隊全裝火銃，三個火銃大隊有一千八百名火銃兵，加上運輸大隊與偵察中隊、炮兵中隊，聯隊總兵力為兩千七百人，較之前少了五百人。但是，在這兩千七百戰兵的基礎上，第一步兵聯隊卻得到了一千名輔兵，充作隨軍苦役，擔負所有與戰鬥無關的事務。
第二步兵聯隊武器裝備五花八門，刀、劍、矛、箭什麽都有，限於沒有軍工生產，無法提供製式武器，所以趙強對第二步兵聯隊的要求是手中有武器就行。並且第二步兵聯隊的編製為八個大隊，總兵力四千八百人。在即將進行的定遠作戰第二階段中，第二步兵聯隊將作為預備役戰鬥隊使用。因第二聯隊多是原俄國人役使的各族偽軍和征用的青壯，所以沒必要給他們配備輔兵，一應事務聯隊自己安排即可。
第二步兵聯隊的聯隊長人選，趙強在征詢過齊壯與胡旺二人的意見後，任何了正坐鎮古裏河城的左銘南擔任，副聯隊一職則由運輸大隊的錢林擔任。二人空缺職務從下麵軍官中依次晉升。
第一騎兵聯隊在得到補充後，依舊保持兩個騎兵大隊的編製；新成立的第二騎兵聯隊同樣也是兩個騎兵大隊的編製，但因繳獲所得的戰馬數量有限，大多數馬匹隻能供運輸拉人使用，所以第二騎兵聯隊隻有一個騎兵大隊可以充當戰鬥兵力使用，另一個大隊暫時是做為騎兵訓練營使用。第二騎兵聯隊長一職由第一聯隊第一騎兵大隊長馬龍擔任，中高級軍官全部從第一騎兵聯隊調入。
由此，兩個騎兵聯隊兵力共計兩千人，兩個步兵聯隊兵員定製八千五百人，不計其他準軍事隊伍，關寧軍兵力擴充為一萬零五百人。此兵力數字是趙強估計的遠東俄軍兵力的三倍左右。
趙強的衛隊已擴充到了兩百人，衛隊長人選由賀滿川擔任，衛隊清一色的騎兵，屬師團近衛中隊。
由於軍官人選極度匱乏，從鬆山堡北上的吳軍舊部除去戰死受傷的，隻有不到三百人，大多數都在第一騎兵聯隊與第一步兵聯隊中充任軍官。因此，新成立的兩個聯隊，趙強任命了一些鄂倫春及索倫軍官，另外，從墨爾根前來的漢人罪犯中也有二十多人因為作戰勇猛，被破格任命為中隊、小隊軍官。
為了解決軍官層的斷代問題，除了大量提拔作戰表現突出的異族士兵外，趙強讓吳四的教導大隊快速運轉起來，整理了一些後世的戰鬥方法，結合吳軍的軍官訓練，爭取在康熙二十三年時，關寧軍的中下軍官層都能受到正規係統的培訓。首批從各個聯隊中抽調的三百預備軍官人選已經先期趕往首義城的教導大隊，因第二階段作戰馬上就要開始，所以各聯隊的現有軍官暫不安排前往教導大隊學習。因為怕吳四大老粗的性格不合自己有關教導大隊的意圖，所以趙強另外又寫信給劉德，將自己的一些想法告之於他，希望他能夠幫助吳四開展軍官訓練工作。
在趙強看來，現在關寧軍的基業越來越大，人口地盤越來越多，正是欣欣向上之時，縱然劉德還有二心，但依他那投機的心態，這時恐怕巴不得出謀獻計，為關寧軍的輝煌再添新功。
占領地內必須有脫離軍事作戰的準軍事組織，以維持治安、征收稅賦等事誼，所以古裏河城、定遠城、雅斯克、首義城各成立一個治安隊，每隊編製三百人。治安隊的軍官由傷殘漢軍或忠誠度過關的異族士兵中的上士擔任。另外在四城交接點建設小型據點，連接交通網驛站，每個小型據點都配備一百名守軍，連同交通網內的驛卒，近三千名青壯在經過簡單訓練後將被分發下去。
出於將關寧軍控製區內所有人口打造成一個整體的軍事集團考慮，第四天的時候，趙強就下令總製府的民曹在各地駐軍和治安隊的配合下，將散居在各處的各族百姓遷入城池與據點周圍，以整合所有人力資源，對於拒不從命的，則予以堅決清洗。
基業剛創，千頭百緒，各地在民曹與軍曹的接手下，已經初步走上軌道，一些基礎的交通建設正在熱火朝天建設當中，但所耗人力甚多，初步估計，連同壯婦在內，近一萬人正在為關寧軍鋪設驛站線路，並進行簡單的道路平整工作。
原先隻是對一個首義城進行管理，現在一下多了這麽多地盤，總製府的工作量數十倍的擴大，民曹各機構的人員也極速膨脹起來，四百多被民曹各司認為完全能適任，且無須提防的賤民被晉為自由民，充任到各司聽候使用。
民政的事情趙強已經放手讓魏季與劉德去做，所以他們如何安排各地城池官，如何有效管治，他都不去過問。趙強要看的隻是結果，其他的他不操心。
此次作戰一共俘虜了三百多俄軍士兵，連同原先被俘虜的，關寧軍中現有俄軍俘虜四百六十人。一番考慮後，十六名軍官被分到教導大隊，六十名士兵被充作各聯隊火銃教官，二十名被分到火炮中隊，其他的全部發給哥薩克中隊。
哥薩克中隊是以那三十多哥薩克人為基礎成立的外番戰鬥部隊，原計劃是將後續俘虜的哥薩克人調入其中，沒想第一階段作戰中並未俘虜哥薩克人，本著不浪費人力的考慮，趙強便將投降與俘虜的俄軍歸入哥薩克中隊，由哥薩克人指揮。
哥薩克人以前受俄國人指揮，現在卻指揮俄國人，真是有趣，這也算是以夷治夷吧。新成立的哥薩克中隊被調到首義城，充當防範滿清進攻的守衛兵力。
韃子不怕漢人，不怕鄂倫春人，不怕蒙古人，卻獨怕羅刹人，現在就讓這些羅刹人替自己擋擋門麵吧，趙強如此想道。