李自成攻北京這段兒時間，大明王朝內部還有著很多勢力。
一是武將集團。
明朝末年，麵臨著內憂外患的嚴峻局麵，內有農民大起義，外有滿清的軍事威脅，軍事上的成敗直接關係著大明王朝的生死存亡，在這種情況下，武將的重要性空前突出，激烈的軍事鬥爭為武將勢力的崛起提供了舞台。
左良玉是明末著名的武將之一，早年在抗清鬥爭中嶄露頭角，受到破格提拔，不久奉命圍剿農民軍，積極作戰，屢次取得勝利，形成了一支著名的左家軍。明末文臣多庸碌無為，對武將多方掣肘，文武矛盾日益突出。在激烈的軍事鬥爭中，左良玉因不願受文臣節製，與文臣之間的矛盾日益尖銳，因而對朝廷的不滿傾向日增，開始積極擴充自己的軍隊，消極作戰，不聽指揮，不僅擺脫了文臣的控製，甚至使朝廷也無可奈何，最終形成了專製一方，不聽節製的軍事集團。
而其它武將也紛紛效仿，朝廷逐漸失去了對武將的絕對控製權，使明軍在戰場上一再潰敗，直接加速了明朝滅亡的步伐。
左良玉也早已經成為勇於虐民、怯於大戰的大軍閥，軍隊殺擄淫掠可謂無惡不作，比之農民軍的部隊還不如。
類似這樣的明朝武將勢力很多很多，說是官，其實比匪徒還不如，甚至更加的殘暴。
武將集團中必需提到一人，就是鄭芝龍，明末清初最大的海商兼軍事集團首領，先後歸附明清兩朝為官，鄭成功的父親，台灣鄭氏王朝的開創者。
鄭芝龍的一生，可以說精彩無比，比之各種穿越小說中的豬腳更像豬腳。
鄭芝龍18歲時，與兄弟齊至澳門的舅父黃程處學習經商，並於澳門接受天主教洗禮，教名Nicolas，因此也被西洋人稱作NicholasIquan（尼古拉·一官）。之後往來東南亞各地，後到日本九州，因習劍術，結識並娶了福建華僑鐵匠翁翊皇的義女田川氏為妻。一開始追隨於日本平戶島的華僑大海盜商人李旦門下，初時擔任翻譯等工作，逐漸成為李旦的得力助手。李旦過世後，鄭芝龍逐漸接收其勢力；1623年接收李旦的事業船隊，經營合法生意，另一手則走私。
1624年中秋後，芝龍將事業重心自日本九州島遷到台灣，歸附“日本甲螺”（倭寇首領）顏思齊。此後不久，荷蘭東印度公司登島，驅逐了以台灣為基地的其他勢力，鄭芝龍遂攜妻子定居於中國大陸。
1625年顏思齊死，芝龍結合諸海盜首領，號稱十八芝，擁有當時福建沿海實力最強大的一支武力及商業團隊，領導海賊數萬人，經營走私與劫掠事業，橫行於台灣海峽。當時泉州府同安知縣寫給福建巡撫的文書中說鄭芝龍雖事劫掠，但對泉州百姓卻是異常仁慈，不但不殺人，甚至救濟貧苦，威望比官家還高。“所到地方但令報水（即通報官府蹤跡），而未嚐殺人。有徹貧者，且以錢米與之。”
1628年，受福建巡撫熊文燦招安，成為官員，率領原部，為明廷守備沿海以防海盜倭寇和荷蘭人進攻，率軍討伐其他昔日結拜契兄弟海盜力量，包括李魁奇、鍾斌，官至總兵。不久便返回福建泉州南安老家，成為當地首富，也是少數迎娶了日本人卻仍能正式返回中國內地的海盜。
1633年芝龍於福建沿海金門海戰擊潰荷屬東印度公司艦隊，從此控製海路、收取各國商船舶靠費用，鄭芝龍也因此迅速富可傾國。儼然稱為閩南的領主與海上霸主，並對繳保護費給芝龍的商船（一艘大船需繳三千兩銀錢），給予鄭家的令旗；如不繳費而想經過芝龍海域的，恐怕難逃被劫的命運。芝龍如此強橫，使荷蘭東印度公司營運不寧，荷蘭人數度聯合其他勢力合取芝龍，但芝龍仍持續擴張其勢力，並將荷蘭人次次打敗。
不久，鄭芝龍應明朝廷要求，繼續率軍討伐其他昔日結拜契兄弟海盜僅存最大股力量劉香，於虎門大獲全勝，名震福建官至都督。不久福建省內發生旱災，鄭芝龍提議載饑民移民台灣，並給予移民十分優惠的資助條件，有人認為其為開創了大規模移民台灣之先河。
如果姬慶不出現，那麽不久之後，南明弘光皇帝冊封鄭芝龍為南安伯，福建總鎮，負責福建全省的抗清軍務。
無論是左良玉，還是鄭芝龍，都是姬慶收服的對象。左良玉，不值得一提。鄭芝龍，可謂大材，不過，姬慶是不可能允許這股處於半獨立的勢力繼續存在，他們必須接受大明朝廷的整編，改造為未來的大明朝海軍。其控製的海上貿易，也要交給朝廷，設立海關，征收賦稅。
當然，姬慶知道就算鄭芝龍會同意，他的勢力中的既得利益者，也不會同意的。利益之下，人是什麽事情都會做出來的。
二是農民軍集團。
現在除了京城外已經整頓完畢的李自成的大軍外，剩下的就是以張獻忠為代表的最大農民武裝了。
崇禎十六年據武昌，稱大西王。不久克長沙，宣布免征三年錢糧，從者愈眾。
之後的曆史，崇禎十七年（1644年）8月9日攻破成都，巡府龍文光，蜀王朱至澍及其嬪妃全部自殺身亡，其他官員當了俘虜。義軍進入成都號稱60萬大軍，很快控製了四川大部分地區的州、縣，在成都，張獻忠先號稱秦王，接著宣告建立大西國，改元大順。建立健全製度，後稱帝，以成都為西京，8月16日登基皇位。
張獻忠在四川確有許多難解之謎，最大的謎可能要算所謂的“張獻忠剿四川”了。
近百年來有許多史學家都驚奇地發現，沒有哪個四川人是土生土長的，幾乎都是“湖廣填四川”，從外省遷來的。明末清初，確實出現過人口大量驟減的事實。難怪當時的民諺這樣說：“歲逢甲乙丙，此地血流紅”，“流流賊，賊流流，上界差他斬人頭。若有一人斬不盡，行瘟使者在後頭。”難道真是張獻忠把四川人殺光了嗎？
清朝期間所編撰的“史料”以及一些“記錄”等都把大屠殺的責任歸於張獻忠。由於清朝的統治延續了兩百七十多年，以至絕大多數人都對此深信不疑。連魯迅先生也曾批判過張獻忠是“專在‘為殺人而殺人’”。
其實，隻要仔細查看一下清兵侵入四川的那段曆史，真相不難知曉。1646年，也即滿清入關後第三個年頭，滿清即宣布張獻忠已被戰死，並宣稱“破一白三十餘營。平四川”，即宣布四川平定。
然而事實並非如此。滿清攻陷渝城（重慶），是在十三年後的1659年。
因此對四川人民的這種頑強不屈的抵抗，清軍采取了徹底屠殺的辦法作為報複。即不論是“張賊”，還是無辜的平民，一律斬殺。
“民·賊相混，玉石難分。或屠全城，或屠男而留女”---這是1649年滿清貼出的公告！！！！！！
這種殘忍的鎮壓方式，在四川竟然持續了很長時間。為了隱瞞真相、欺騙中國人，滿清居然把他們自己幹的這些大屠殺全部栽贓給張獻忠！
試想，假如張獻忠真如滿清韃虜所宣傳的那樣，“是一個瘋狂的殺人魔王。四川交通可達的人煙稠密之處，差不多被他殺絕”，那麽，幾乎沒有人煙的四川，何能抵抗十多年？
已經到了“彌望千裏，絕無人煙”的地步，何需“勞駕”韃虜們花費十多年時間去平定？
這不是明顯的矛盾嘛。四川人民的反清活動被殘忍地鎮壓後，的確是到了“彌望千裏，絕無人煙”的地步。清廷不得不遷移湖廣的人口至四川（即有名的以湖廣填四川）。造成這種慘狀的不正是韃虜們嗎？可見當時的韃虜們不僅窮凶極惡、而且栽贓的手法也卑鄙至極。
當然越是誇張和宣傳張獻忠的“屠殺”，就越能證明真正的劊子手們的行為是“正義”的。這是小學生都知道的道理。滿清統治了兩百多年，戰敗一方的記錄早就被毀滅或被篡改，留下的隻是有利於自己的“記錄”和當時的宣傳，這樣的“曆史”代代相傳，兩百年後的百姓也就很自然地信了。
如上麵的例子，還是可以從滿清自己的記錄裏找到矛盾的地方，從而還回曆史的真麵目。也有後來的出土文物戳穿了當時滿清所製造的、流傳兩百多年的謊言。
而姬慶後來對於張獻忠部的探查，也證明了這一點兒，至少，張獻忠不是個嗜殺之人。否則，人都殺了，誰還跟著他當兵？！人都殺了，賦稅哪裏來？光靠搶，就能稱王稱霸？
仙城降臨、仙人臨世，估計隻有親自看到的人才會相信吧。即使這個天大的信息很快傳遍了全國，但是想讓國內的人們都相信，那是根本不可能的。尤其是那些手中掌握著軍隊、半獨立性質的勢力，更是不可能依此就對京城那邊束手就擒。
所以，收服的同時，遇到了抵抗，也有了清剿的需求。比如對於左良玉、鄭芝龍、張獻忠等等這樣的勢力集團，就必須如此。
好在，如果仙人真的出現在他們麵前的時候，表現出刀槍不入或者各種匪夷所思的能力的時候，無論多麽自信的人，也會有絕望之感。
於是，在姬慶派出的子體飛天部隊的接觸之下，左良玉、鄭芝龍、張獻忠等等大勢力，都歸降了大明朝廷，各項整編工作，也在進行當中。
就這樣，在姬慶來到大明一個月的時間之內，除去滿清外所有不受控製的勢力都被掃蕩一空，大明對於地方的統治也重新恢複了正常，各項改革措施、新的製度也在進行當中。
大明的未來，會越來越好。